Protein–RNA interactions for Protein: Q3UC65

Rsrp1, Arginine/serine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsrp1Q3UC65 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsrp1Q3UC65 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rsrp1Q3UC65 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsrp1Q3UC65 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsrp1Q3UC65 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsrp1Q3UC65 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsrp1Q3UC65 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rsrp1Q3UC65 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsrp1Q3UC65 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsrp1Q3UC65 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsrp1Q3UC65 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rsrp1Q3UC65 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsrp1Q3UC65 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsrp1Q3UC65 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsrp1Q3UC65 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rsrp1Q3UC65 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rsrp1Q3UC65 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rsrp1Q3UC65 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rsrp1Q3UC65 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rsrp1Q3UC65 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rsrp1Q3UC65 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsrp1Q3UC65 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rsrp1Q3UC65 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsrp1Q3UC65 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsrp1Q3UC65 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsrp1Q3UC65 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rsrp1Q3UC65 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsrp1Q3UC65 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rsrp1Q3UC65 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsrp1Q3UC65 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rsrp1Q3UC65 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms