Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ctu2Q3U308 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctu2Q3U308 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctu2Q3U308 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctu2Q3U308 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctu2Q3U308 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms