Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hvcn1Q3U2S8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hvcn1Q3U2S8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hvcn1Q3U2S8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hvcn1Q3U2S8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hvcn1Q3U2S8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hvcn1Q3U2S8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hvcn1Q3U2S8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hvcn1Q3U2S8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hvcn1Q3U2S8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hvcn1Q3U2S8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hvcn1Q3U2S8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hvcn1Q3U2S8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hvcn1Q3U2S8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hvcn1Q3U2S8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hvcn1Q3U2S8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hvcn1Q3U2S8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hvcn1Q3U2S8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hvcn1Q3U2S8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hvcn1Q3U2S8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hvcn1Q3U2S8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hvcn1Q3U2S8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hvcn1Q3U2S8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms