Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Traf3ip1Q149C2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Traf3ip1Q149C2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Traf3ip1Q149C2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Traf3ip1Q149C2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Traf3ip1Q149C2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Traf3ip1Q149C2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Traf3ip1Q149C2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Traf3ip1Q149C2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Traf3ip1Q149C2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Traf3ip1Q149C2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Traf3ip1Q149C2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Traf3ip1Q149C2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Traf3ip1Q149C2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Traf3ip1Q149C2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Traf3ip1Q149C2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Traf3ip1Q149C2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Traf3ip1Q149C2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Traf3ip1Q149C2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Traf3ip1Q149C2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Traf3ip1Q149C2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Traf3ip1Q149C2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Traf3ip1Q149C2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Traf3ip1Q149C2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Traf3ip1Q149C2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Traf3ip1Q149C2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Traf3ip1Q149C2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Traf3ip1Q149C2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Traf3ip1Q149C2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Traf3ip1Q149C2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Traf3ip1Q149C2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Traf3ip1Q149C2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Traf3ip1Q149C2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Traf3ip1Q149C2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Traf3ip1Q149C2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms