Protein–RNA interactions for Protein: Q12297

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF3Q12297 YTH1YPR107C 627 nt7.31□□□□□ -1.24
TAF3Q12297 PRP2YNR011C 2631 nt7.31□□□□□ -1.24
TAF3Q12297 YOR389WYOR389W 1875 nt7.3□□□□□ -1.24
TAF3Q12297 PAC10YGR078C 600 nt7.3□□□□□ -1.24
TAF3Q12297 NAP1YKR048C 1254 nt7.3□□□□□ -1.24
TAF3Q12297 ADE17YMR120C 1779 nt7.3□□□□□ -1.24
TAF3Q12297 ACO1YLR304C 2337 nt7.29□□□□□ -1.24
TAF3Q12297 SRP102YKL154W 735 nt7.29□□□□□ -1.24
TAF3Q12297 NUP57YGR119C 1626 nt7.29□□□□□ -1.24
TAF3Q12297 TIM50YPL063W 1431 nt7.28□□□□□ -1.24
TAF3Q12297 CBK1YNL161W 2271 nt7.28□□□□□ -1.24
TAF3Q12297 YDR215CYDR215C 414 nt7.28□□□□□ -1.24
TAF3Q12297 HHY1YEL059W 309 nt7.28□□□□□ -1.24
TAF3Q12297 LIP5YOR196C 1245 nt7.28□□□□□ -1.24
TAF3Q12297 CDC3YLR314C 1563 nt7.28□□□□□ -1.24
TAF3Q12297 MLS1YNL117W 1665 nt7.28□□□□□ -1.24
TAF3Q12297 ICL2YPR006C 1728 nt7.27□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 YIP4YGL198W 708 nt7.27□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 CYC3YAL039C 810 nt7.27□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 YLR112WYLR112W 420 nt7.27□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 YMR166CYMR166C 1107 nt7.27□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 BXI1YNL305C 894 nt7.27□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 ERO1YML130C 1692 nt7.27□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 BIM1YER016W 1035 nt7.26□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 FLX1YIL134W 936 nt7.26□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 YKL147CYKL147C 618 nt7.26□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 KIN1YDR122W 3195 nt7.25□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 RQC1YDR333C 2172 nt7.25□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 YGL260WYGL260W 231 nt7.25□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 VTS1YOR359W 1572 nt7.25□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 SRN2YLR119W 642 nt7.24□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 YHM2YMR241W 945 nt7.24□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 SSC1YJR045C 1965 nt7.24□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 EXG2YDR261C 1689 nt7.23□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 ADH7YCR105W 1086 nt7.23□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 DAL80YKR034W 810 nt7.23□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 MEU1YLR017W 1014 nt7.23□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 DPH5YLR172C 903 nt7.23□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 JHD1YER051W 1479 nt7.23□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 MGM101YJR144W 810 nt7.22□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 AGP2YBR132C 1791 nt7.22□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 ERG24YNL280C 1317 nt7.22□□□□□ -1.25
TAF3Q12297 LSP1YPL004C 1026 nt7.21□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 SEC23YPR181C 2307 nt7.21□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 CPR2YHR057C 618 nt7.2□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 PMU1YKL128C 888 nt7.2□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 EFM1YHL039W 1758 nt7.2□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.19□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.19□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.19□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.19□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.19□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.19□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.19□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.19□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.19□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.19□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.19□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 RRT14YIL127C 621 nt7.19□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt7.19□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 SGE1YPR198W 1632 nt7.19□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 HAL5YJL165C 2568 nt7.18□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.18□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 RRN10YBL025W 438 nt7.18□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 AFG3YER017C 2286 nt7.18□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 CPD1YGR247W 720 nt7.17□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 FAF1YIL019W 1041 nt7.17□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 CYB2YML054C 1776 nt7.16□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 BNS1YGR230W 414 nt7.16□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 BMT5YIL096C 1011 nt7.16□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 IPL1YPL209C 1104 nt7.16□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 MTR3YGR158C 753 nt7.15□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 REC114YMR133W 1287 nt7.15□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 ARC35YNR035C 1029 nt7.15□□□□□ -1.26
TAF3Q12297 YMR206WYMR206W 942 nt7.14□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 MCH2YKL221W 1422 nt7.13□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 OPI1YHL020C 1215 nt7.13□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 HMT1YBR034C 1047 nt7.13□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 PAU5YFL020C 369 nt7.12□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 NTG1YAL015C 1200 nt7.12□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 PUS5YLR165C 765 nt7.12□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 SMK1YPR054W 1167 nt7.12□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 SNT309YPR101W 528 nt7.12□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 YGR210CYGR210C 1236 nt7.11□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 STE3YKL178C 1413 nt7.1□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 ERG12YMR208W 1332 nt7.1□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 GET2YER083C 858 nt7.1□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 RPL2BYIL018W 765 nt7.1□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 RGT2YDL138W 2292 nt7.1□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 INP54YOL065C 1155 nt7.09□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 RPS6AYPL090C 711 nt7.09□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 RPS6BYBR181C 711 nt7.09□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 NUP84YDL116W 2181 nt7.09□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 DAL4YIR028W 1908 nt7.09□□□□□ -1.27
TAF3Q12297 GPA1YHR005C 1419 nt7.09□□□□□ -1.28
TAF3Q12297 YNL295WYNL295W 1575 nt7.08□□□□□ -1.28
TAF3Q12297 ERS1YCR075C 783 nt7.08□□□□□ -1.28
TAF3Q12297 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.08□□□□□ -1.28
TAF3Q12297 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.08□□□□□ -1.28
TAF3Q12297 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.7 ms