Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SctQ08535 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SctQ08535 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SctQ08535 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SctQ08535 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SctQ08535 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SctQ08535 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SctQ08535 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SctQ08535 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SctQ08535 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SctQ08535 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SctQ08535 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SctQ08535 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SctQ08535 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SctQ08535 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SctQ08535 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SctQ08535 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SctQ08535 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SctQ08535 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SctQ08535 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SctQ08535 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SctQ08535 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SctQ08535 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SctQ08535 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SctQ08535 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SctQ08535 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SctQ08535 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SctQ08535 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SctQ08535 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SctQ08535 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SctQ08535 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SctQ08535 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SctQ08535 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SctQ08535 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SctQ08535 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SctQ08535 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SctQ08535 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SctQ08535 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SctQ08535 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SctQ08535 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SctQ08535 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SctQ08535 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SctQ08535 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SctQ08535 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SctQ08535 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SctQ08535 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SctQ08535 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SctQ08535 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SctQ08535 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SctQ08535 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SctQ08535 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SctQ08535 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SctQ08535 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SctQ08535 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SctQ08535 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SctQ08535 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SctQ08535 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SctQ08535 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SctQ08535 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SctQ08535 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SctQ08535 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SctQ08535 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SctQ08535 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SctQ08535 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SctQ08535 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SctQ08535 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SctQ08535 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SctQ08535 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SctQ08535 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SctQ08535 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SctQ08535 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SctQ08535 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SctQ08535 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SctQ08535 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SctQ08535 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SctQ08535 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SctQ08535 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SctQ08535 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SctQ08535 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SctQ08535 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SctQ08535 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SctQ08535 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SctQ08535 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SctQ08535 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SctQ08535 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SctQ08535 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SctQ08535 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SctQ08535 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SctQ08535 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SctQ08535 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SctQ08535 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SctQ08535 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SctQ08535 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SctQ08535 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SctQ08535 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SctQ08535 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SctQ08535 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SctQ08535 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SctQ08535 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SctQ08535 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms