Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Col17a1Q07563 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Col17a1Q07563 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Col17a1Q07563 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Col17a1Q07563 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Col17a1Q07563 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Col17a1Q07563 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Col17a1Q07563 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Col17a1Q07563 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
Col17a1Q07563 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Col17a1Q07563 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Col17a1Q07563 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Col17a1Q07563 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Col17a1Q07563 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Col17a1Q07563 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Col17a1Q07563 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Col17a1Q07563 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Col17a1Q07563 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Col17a1Q07563 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Col17a1Q07563 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Col17a1Q07563 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Col17a1Q07563 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Col17a1Q07563 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Col17a1Q07563 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
Col17a1Q07563 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Col17a1Q07563 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Col17a1Q07563 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Col17a1Q07563 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Col17a1Q07563 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Col17a1Q07563 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Col17a1Q07563 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Col17a1Q07563 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Col17a1Q07563 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Col17a1Q07563 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Col17a1Q07563 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Col17a1Q07563 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Col17a1Q07563 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Col17a1Q07563 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Col17a1Q07563 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Col17a1Q07563 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Col17a1Q07563 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Col17a1Q07563 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Col17a1Q07563 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Col17a1Q07563 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Col17a1Q07563 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Col17a1Q07563 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Col17a1Q07563 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Col17a1Q07563 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Col17a1Q07563 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Col17a1Q07563 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Col17a1Q07563 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Col17a1Q07563 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Col17a1Q07563 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Col17a1Q07563 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Col17a1Q07563 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Col17a1Q07563 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Col17a1Q07563 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Col17a1Q07563 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
Col17a1Q07563 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
Col17a1Q07563 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Col17a1Q07563 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Col17a1Q07563 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Col17a1Q07563 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Col17a1Q07563 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms