Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cdx4Q07424 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdx4Q07424 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdx4Q07424 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 349.9 ms