Protein–RNA interactions for Protein: Q05CL8

Larp7, La-related protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp7Q05CL8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Larp7Q05CL8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Larp7Q05CL8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Larp7Q05CL8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Larp7Q05CL8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Larp7Q05CL8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Larp7Q05CL8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Larp7Q05CL8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Larp7Q05CL8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Larp7Q05CL8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Larp7Q05CL8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Larp7Q05CL8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Larp7Q05CL8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Larp7Q05CL8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Larp7Q05CL8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Larp7Q05CL8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Larp7Q05CL8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Larp7Q05CL8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Larp7Q05CL8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Larp7Q05CL8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Larp7Q05CL8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Larp7Q05CL8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms