Protein–RNA interactions for Protein: Q00899

Yy1, Transcriptional repressor protein YY1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yy1Q00899 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Yy1Q00899 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Yy1Q00899 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Yy1Q00899 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Yy1Q00899 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Yy1Q00899 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Yy1Q00899 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Yy1Q00899 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Yy1Q00899 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Yy1Q00899 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Yy1Q00899 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Yy1Q00899 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Yy1Q00899 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Yy1Q00899 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Yy1Q00899 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Yy1Q00899 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Yy1Q00899 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Yy1Q00899 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Yy1Q00899 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Yy1Q00899 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Yy1Q00899 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Yy1Q00899 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Yy1Q00899 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Yy1Q00899 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Yy1Q00899 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Yy1Q00899 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Yy1Q00899 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Yy1Q00899 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Yy1Q00899 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Yy1Q00899 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Yy1Q00899 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Yy1Q00899 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Yy1Q00899 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Yy1Q00899 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Yy1Q00899 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Yy1Q00899 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Yy1Q00899 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Yy1Q00899 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Yy1Q00899 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Yy1Q00899 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Yy1Q00899 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Yy1Q00899 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Yy1Q00899 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Yy1Q00899 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Yy1Q00899 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Yy1Q00899 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Yy1Q00899 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Yy1Q00899 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Yy1Q00899 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Yy1Q00899 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Yy1Q00899 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Yy1Q00899 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Yy1Q00899 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Yy1Q00899 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Yy1Q00899 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Yy1Q00899 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Yy1Q00899 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Yy1Q00899 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Yy1Q00899 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Yy1Q00899 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Yy1Q00899 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Yy1Q00899 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Yy1Q00899 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Yy1Q00899 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Yy1Q00899 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Yy1Q00899 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Yy1Q00899 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Yy1Q00899 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Yy1Q00899 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Yy1Q00899 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Yy1Q00899 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Yy1Q00899 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Yy1Q00899 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Yy1Q00899 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Yy1Q00899 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Yy1Q00899 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Yy1Q00899 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Yy1Q00899 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Yy1Q00899 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Yy1Q00899 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Yy1Q00899 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Yy1Q00899 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Yy1Q00899 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms