Protein–RNA interactions for Protein: Q00898

Serpina1e, Alpha-1-antitrypsin 1-5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1eQ00898 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Serpina1eQ00898 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Serpina1eQ00898 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Serpina1eQ00898 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Serpina1eQ00898 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Serpina1eQ00898 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Serpina1eQ00898 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Serpina1eQ00898 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Serpina1eQ00898 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Serpina1eQ00898 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms