Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apoa1Q00623 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apoa1Q00623 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Apoa1Q00623 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apoa1Q00623 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms