Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps3aP97351 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps3aP97351 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rps3aP97351 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps3aP97351 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rps3aP97351 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rps3aP97351 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rps3aP97351 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Rps3aP97351 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rps3aP97351 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rps3aP97351 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps3aP97351 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps3aP97351 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps3aP97351 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps3aP97351 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps3aP97351 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rps3aP97351 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps3aP97351 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps3aP97351 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps3aP97351 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps3aP97351 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rps3aP97351 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps3aP97351 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps3aP97351 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps3aP97351 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rps3aP97351 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps3aP97351 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps3aP97351 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rps3aP97351 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps3aP97351 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rps3aP97351 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps3aP97351 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps3aP97351 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps3aP97351 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps3aP97351 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps3aP97351 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps3aP97351 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rps3aP97351 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps3aP97351 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps3aP97351 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rps3aP97351 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rps3aP97351 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps3aP97351 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps3aP97351 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps3aP97351 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps3aP97351 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Rps3aP97351 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps3aP97351 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps3aP97351 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps3aP97351 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps3aP97351 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms