Protein–RNA interactions for Protein: P97291

Cdh8, Cadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh8P97291 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdh8P97291 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdh8P97291 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh8P97291 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh8P97291 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh8P97291 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh8P97291 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh8P97291 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh8P97291 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh8P97291 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh8P97291 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdh8P97291 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdh8P97291 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdh8P97291 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdh8P97291 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh8P97291 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdh8P97291 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdh8P97291 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdh8P97291 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdh8P97291 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdh8P97291 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdh8P97291 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdh8P97291 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdh8P97291 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms