Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frat1P70339 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frat1P70339 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Frat1P70339 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Frat1P70339 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Frat1P70339 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frat1P70339 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Frat1P70339 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Frat1P70339 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms