Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hoxb13P70321 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Hoxb13P70321 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hoxb13P70321 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxb13P70321 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxb13P70321 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxb13P70321 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxb13P70321 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxb13P70321 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxb13P70321 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxb13P70321 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxb13P70321 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxb13P70321 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxb13P70321 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxb13P70321 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxb13P70321 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxb13P70321 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxb13P70321 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxb13P70321 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxb13P70321 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxb13P70321 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxb13P70321 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxb13P70321 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms