Protein–RNA interactions for Protein: P70166

Cpeb1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpeb1P70166 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cpeb1P70166 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpeb1P70166 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpeb1P70166 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpeb1P70166 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpeb1P70166 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cpeb1P70166 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpeb1P70166 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cpeb1P70166 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cpeb1P70166 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cpeb1P70166 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpeb1P70166 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cpeb1P70166 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cpeb1P70166 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpeb1P70166 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpeb1P70166 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpeb1P70166 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cpeb1P70166 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpeb1P70166 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cpeb1P70166 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms