Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ufm1P61961 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ufm1P61961 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ufm1P61961 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ufm1P61961 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ufm1P61961 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms