Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Paxbp1P58501 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Paxbp1P58501 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Paxbp1P58501 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Paxbp1P58501 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Paxbp1P58501 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Paxbp1P58501 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Paxbp1P58501 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Paxbp1P58501 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Paxbp1P58501 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Paxbp1P58501 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Paxbp1P58501 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Paxbp1P58501 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Paxbp1P58501 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Paxbp1P58501 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Paxbp1P58501 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Paxbp1P58501 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Paxbp1P58501 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Paxbp1P58501 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Paxbp1P58501 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Paxbp1P58501 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms