Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smpdl3bP58242 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smpdl3bP58242 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smpdl3bP58242 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smpdl3bP58242 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smpdl3bP58242 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms