Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Usp25P57080 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp25P57080 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Usp25P57080 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp25P57080 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp25P57080 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp25P57080 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp25P57080 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Usp25P57080 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp25P57080 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp25P57080 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp25P57080 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Usp25P57080 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Usp25P57080 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Usp25P57080 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Usp25P57080 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp25P57080 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Usp25P57080 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp25P57080 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Usp25P57080 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp25P57080 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Usp25P57080 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp25P57080 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Usp25P57080 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp25P57080 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp25P57080 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Usp25P57080 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
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