Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcd3P55096 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcd3P55096 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abcd3P55096 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd3P55096 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms