Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Csrp3P50462 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Csrp3P50462 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Csrp3P50462 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Csrp3P50462 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csrp3P50462 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Csrp3P50462 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Csrp3P50462 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Csrp3P50462 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrp3P50462 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrp3P50462 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrp3P50462 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Csrp3P50462 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrp3P50462 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrp3P50462 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrp3P50462 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Csrp3P50462 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrp3P50462 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Csrp3P50462 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Csrp3P50462 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csrp3P50462 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms