Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt6aP50446 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt6aP50446 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt6aP50446 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt6aP50446 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt6aP50446 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt6aP50446 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt6aP50446 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt6aP50446 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt6aP50446 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt6aP50446 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt6aP50446 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt6aP50446 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt6aP50446 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt6aP50446 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt6aP50446 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt6aP50446 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt6aP50446 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt6aP50446 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt6aP50446 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt6aP50446 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt6aP50446 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt6aP50446 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt6aP50446 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt6aP50446 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt6aP50446 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms