Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Epb41P48193 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Epb41P48193 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epb41P48193 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epb41P48193 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epb41P48193 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Epb41P48193 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epb41P48193 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epb41P48193 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epb41P48193 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Epb41P48193 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms