Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sdc2P43407 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sdc2P43407 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sdc2P43407 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sdc2P43407 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sdc2P43407 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sdc2P43407 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sdc2P43407 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sdc2P43407 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sdc2P43407 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sdc2P43407 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sdc2P43407 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sdc2P43407 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sdc2P43407 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sdc2P43407 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sdc2P43407 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sdc2P43407 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sdc2P43407 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sdc2P43407 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sdc2P43407 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sdc2P43407 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sdc2P43407 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sdc2P43407 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sdc2P43407 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms