Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 HDA1YNL021W 2121 nt7.42□□□□□ -1.22
SEC28P40509 PSA1YDL055C 1086 nt7.42□□□□□ -1.22
SEC28P40509 STS1YIR011C 960 nt7.42□□□□□ -1.22
SEC28P40509 ADE1YAR015W 921 nt7.42□□□□□ -1.22
SEC28P40509 VPS65YLR322W 315 nt7.42□□□□□ -1.22
SEC28P40509 TOS1YBR162C 1368 nt7.42□□□□□ -1.22
SEC28P40509 YIL108WYIL108W 2091 nt7.42□□□□□ -1.22
SEC28P40509 YDR215CYDR215C 414 nt7.41□□□□□ -1.22
SEC28P40509 YDR476CYDR476C 675 nt7.41□□□□□ -1.22
SEC28P40509 BIM1YER016W 1035 nt7.41□□□□□ -1.22
SEC28P40509 GNA1YFL017C 480 nt7.41□□□□□ -1.22
SEC28P40509 YLR030WYLR030W 792 nt7.41□□□□□ -1.22
SEC28P40509 YAH1YPL252C 519 nt7.41□□□□□ -1.22
SEC28P40509 AFG2YLR397C 2343 nt7.41□□□□□ -1.22
SEC28P40509 DCR2YLR361C 1737 nt7.41□□□□□ -1.22
SEC28P40509 TPI1YDR050C 747 nt7.4□□□□□ -1.22
SEC28P40509 YJL043WYJL043W 774 nt7.4□□□□□ -1.22
SEC28P40509 SNA3YJL151C 402 nt7.4□□□□□ -1.22
SEC28P40509 SGV1YPR161C 1974 nt7.4□□□□□ -1.23
SEC28P40509 CKI1YLR133W 1749 nt7.39□□□□□ -1.23
SEC28P40509 YDR327WYDR327W 327 nt7.39□□□□□ -1.23
SEC28P40509 PAU21YOR394W 495 nt7.39□□□□□ -1.23
SEC28P40509 PAU22YPL282C 495 nt7.39□□□□□ -1.23
SEC28P40509 PPZ2YDR436W 2133 nt7.39□□□□□ -1.23
SEC28P40509 OSM1YJR051W 1506 nt7.38□□□□□ -1.23
SEC28P40509 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.38□□□□□ -1.23
SEC28P40509 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.38□□□□□ -1.23
SEC28P40509 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.38□□□□□ -1.23
SEC28P40509 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.38□□□□□ -1.23
SEC28P40509 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.38□□□□□ -1.23
SEC28P40509 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.38□□□□□ -1.23
SEC28P40509 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.38□□□□□ -1.23
SEC28P40509 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.38□□□□□ -1.23
SEC28P40509 ERV2YPR037C 591 nt7.38□□□□□ -1.23
SEC28P40509 YCR061WYCR061W 1896 nt7.38□□□□□ -1.23
SEC28P40509 MAL31YBR298C 1845 nt7.38□□□□□ -1.23
SEC28P40509 YBL113CYBL113C 2379 nt7.38□□□□□ -1.23
SEC28P40509 PRC1YMR297W 1599 nt7.37□□□□□ -1.23
SEC28P40509 SPS1YDR523C 1473 nt7.37□□□□□ -1.23
SEC28P40509 MSB3YNL293W 1902 nt7.37□□□□□ -1.23
SEC28P40509 OPI1YHL020C 1215 nt7.37□□□□□ -1.23
SEC28P40509 AIM34YMR003W 597 nt7.37□□□□□ -1.23
SEC28P40509 YOR041CYOR041C 432 nt7.37□□□□□ -1.23
SEC28P40509 DSC3YOR223W 879 nt7.37□□□□□ -1.23
SEC28P40509 ERG24YNL280C 1317 nt7.36□□□□□ -1.23
SEC28P40509 DAL7YIR031C 1665 nt7.36□□□□□ -1.23
SEC28P40509 CHA1YCL064C 1083 nt7.35□□□□□ -1.23
SEC28P40509 YOR300WYOR300W 309 nt7.35□□□□□ -1.23
SEC28P40509 YPL041CYPL041C 624 nt7.35□□□□□ -1.23
SEC28P40509 HNM1YGL077C 1692 nt7.35□□□□□ -1.23
SEC28P40509 HAL5YJL165C 2568 nt7.34□□□□□ -1.23
SEC28P40509 GTS1YGL181W 1191 nt7.34□□□□□ -1.23
SEC28P40509 PRY2YKR013W 990 nt7.34□□□□□ -1.23
SEC28P40509 ADH6YMR318C 1083 nt7.34□□□□□ -1.23
SEC28P40509 DPH5YLR172C 903 nt7.33□□□□□ -1.24
SEC28P40509 YOR343CYOR343C 327 nt7.33□□□□□ -1.24
SEC28P40509 YJR142WYJR142W 1029 nt7.32□□□□□ -1.24
SEC28P40509 ATP10YLR393W 840 nt7.32□□□□□ -1.24
SEC28P40509 ITR1YDR497C 1755 nt7.32□□□□□ -1.24
SEC28P40509 PET494YNR045W 1470 nt7.31□□□□□ -1.24
SEC28P40509 TCB1YOR086C 3561 nt7.31□□□□□ -1.24
SEC28P40509 SKP1YDR328C 585 nt7.31□□□□□ -1.24
SEC28P40509 BUD20YLR074C 501 nt7.31□□□□□ -1.24
SEC28P40509 FUS3YBL016W 1062 nt7.31□□□□□ -1.24
SEC28P40509 HXT13YEL069C 1695 nt7.31□□□□□ -1.24
SEC28P40509 BDS1YOL164W 1941 nt7.31□□□□□ -1.24
SEC28P40509 CDC23YHR166C 1881 nt7.3□□□□□ -1.24
SEC28P40509 MSS51YLR203C 1311 nt7.29□□□□□ -1.24
SEC28P40509 YGL081WYGL081W 963 nt7.29□□□□□ -1.24
SEC28P40509 NCA3YJL116C 1014 nt7.29□□□□□ -1.24
SEC28P40509 YHC3YJL059W 1227 nt7.28□□□□□ -1.24
SEC28P40509 HRB1YNL004W 1365 nt7.27□□□□□ -1.25
SEC28P40509 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.26□□□□□ -1.25
SEC28P40509 YLR358CYLR358C 564 nt7.26□□□□□ -1.25
SEC28P40509 MSI1YBR195C 1269 nt7.26□□□□□ -1.25
SEC28P40509 MAS2YHR024C 1449 nt7.26□□□□□ -1.25
SEC28P40509 CAN1YEL063C 1773 nt7.25□□□□□ -1.25
SEC28P40509 AFG3YER017C 2286 nt7.25□□□□□ -1.25
SEC28P40509 YEN1YER041W 2280 nt7.25□□□□□ -1.25
SEC28P40509 CIR2YOR356W 1896 nt7.25□□□□□ -1.25
SEC28P40509 ERR3YMR323W 1314 nt7.25□□□□□ -1.25
SEC28P40509 ERR1YOR393W 1314 nt7.25□□□□□ -1.25
SEC28P40509 ERR2YPL281C 1314 nt7.25□□□□□ -1.25
SEC28P40509 TOP3YLR234W 1971 nt7.24□□□□□ -1.25
SEC28P40509 NMA2YGR010W 1188 nt7.24□□□□□ -1.25
SEC28P40509 LIP5YOR196C 1245 nt7.24□□□□□ -1.25
SEC28P40509 NMD5YJR132W 3147 nt7.24□□□□□ -1.25
SEC28P40509 ASN2YGR124W 1719 nt7.24□□□□□ -1.25
SEC28P40509 PIL1YGR086C 1020 nt7.23□□□□□ -1.25
SEC28P40509 YKL147CYKL147C 618 nt7.23□□□□□ -1.25
SEC28P40509 PAM17YKR065C 594 nt7.23□□□□□ -1.25
SEC28P40509 YMR253CYMR253C 1245 nt7.23□□□□□ -1.25
SEC28P40509 CDC3YLR314C 1563 nt7.23□□□□□ -1.25
SEC28P40509 YNL040WYNL040W 1371 nt7.22□□□□□ -1.25
SEC28P40509 KAE1YKR038C 1161 nt7.22□□□□□ -1.25
SEC28P40509 CCW12YLR110C 402 nt7.22□□□□□ -1.25
SEC28P40509 YOS9YDR057W 1629 nt7.22□□□□□ -1.25
SEC28P40509 RPL12BYDR418W 498 nt7.21□□□□□ -1.26
SEC28P40509 YGL260WYGL260W 231 nt7.21□□□□□ -1.26
SEC28P40509 YJL213WYJL213W 996 nt7.21□□□□□ -1.26
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