Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VhlP40338 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VhlP40338 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VhlP40338 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VhlP40338 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VhlP40338 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VhlP40338 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VhlP40338 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VhlP40338 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VhlP40338 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VhlP40338 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VhlP40338 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VhlP40338 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VhlP40338 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VhlP40338 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VhlP40338 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VhlP40338 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VhlP40338 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VhlP40338 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VhlP40338 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VhlP40338 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VhlP40338 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VhlP40338 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VhlP40338 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VhlP40338 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VhlP40338 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VhlP40338 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VhlP40338 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VhlP40338 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VhlP40338 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VhlP40338 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VhlP40338 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VhlP40338 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VhlP40338 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VhlP40338 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VhlP40338 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VhlP40338 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VhlP40338 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VhlP40338 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VhlP40338 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VhlP40338 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VhlP40338 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VhlP40338 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VhlP40338 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VhlP40338 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VhlP40338 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VhlP40338 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VhlP40338 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VhlP40338 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VhlP40338 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VhlP40338 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VhlP40338 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VhlP40338 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VhlP40338 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VhlP40338 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VhlP40338 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VhlP40338 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VhlP40338 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VhlP40338 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VhlP40338 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VhlP40338 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VhlP40338 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VhlP40338 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VhlP40338 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VhlP40338 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VhlP40338 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VhlP40338 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VhlP40338 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VhlP40338 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VhlP40338 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VhlP40338 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VhlP40338 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VhlP40338 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VhlP40338 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VhlP40338 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VhlP40338 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VhlP40338 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VhlP40338 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VhlP40338 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VhlP40338 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VhlP40338 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VhlP40338 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VhlP40338 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VhlP40338 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VhlP40338 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VhlP40338 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VhlP40338 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VhlP40338 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VhlP40338 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VhlP40338 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VhlP40338 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VhlP40338 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VhlP40338 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VhlP40338 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VhlP40338 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VhlP40338 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VhlP40338 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VhlP40338 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VhlP40338 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VhlP40338 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 281.7 ms