Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxcr2P35343 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cxcr2P35343 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cxcr2P35343 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cxcr2P35343 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cxcr2P35343 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cxcr2P35343 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cxcr2P35343 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms