Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp4P35123 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp4P35123 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp4P35123 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp4P35123 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp4P35123 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp4P35123 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp4P35123 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp4P35123 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp4P35123 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp4P35123 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp4P35123 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp4P35123 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp4P35123 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp4P35123 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp4P35123 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp4P35123 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp4P35123 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp4P35123 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp4P35123 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp4P35123 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp4P35123 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp4P35123 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp4P35123 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp4P35123 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp4P35123 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.9 ms