Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klra1P20937 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klra1P20937 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klra1P20937 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klra1P20937 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klra1P20937 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klra1P20937 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klra1P20937 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klra1P20937 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klra1P20937 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klra1P20937 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klra1P20937 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klra1P20937 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Klra1P20937 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klra1P20937 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klra1P20937 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klra1P20937 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klra1P20937 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klra1P20937 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klra1P20937 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klra1P20937 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klra1P20937 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Klra1P20937 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klra1P20937 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klra1P20937 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klra1P20937 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms