Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

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Length 128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cox5bP19536 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cox5bP19536 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cox5bP19536 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cox5bP19536 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cox5bP19536 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cox5bP19536 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cox5bP19536 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cox5bP19536 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cox5bP19536 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cox5bP19536 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cox5bP19536 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cox5bP19536 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cox5bP19536 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cox5bP19536 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cox5bP19536 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cox5bP19536 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cox5bP19536 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cox5bP19536 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms