Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ms4a1P19437 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ms4a1P19437 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ms4a1P19437 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ms4a1P19437 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms