Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-AaP01910 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
H2-AaP01910 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
H2-AaP01910 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-AaP01910 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-AaP01910 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-AaP01910 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
H2-AaP01910 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-AaP01910 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2-AaP01910 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-AaP01910 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-AaP01910 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-AaP01910 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
H2-AaP01910 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-AaP01910 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2-AaP01910 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2-AaP01910 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms