Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01672 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01672 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01672 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01672 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P01672 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01672 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01672 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01672 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01672 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
P01672 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01672 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01672 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01672 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01672 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01672 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01672 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01672 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01672 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01672 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01672 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01672 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
P01672 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01672 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01672 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01672 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01672 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01672 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01672 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01672 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01672 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01672 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01672 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01672 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
P01672 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01672 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01672 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01672 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01672 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01672 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01672 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01672 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01672 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
P01672 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01672 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
P01672 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01672 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
P01672 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01672 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P01672 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01672 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
P01672 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01672 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01672 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01672 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01672 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01672 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01672 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01672 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01672 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01672 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01672 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01672 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P01672 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
P01672 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01672 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01672 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P01672 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01672 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01672 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
P01672 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01672 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01672 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01672 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01672 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01672 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01672 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P01672 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
P01672 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
P01672 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01672 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
P01672 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01672 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
P01672 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01672 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01672 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01672 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01672 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01672 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01672 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
P01672 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01672 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01672 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01672 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01672 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01672 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01672 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01672 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P01672 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P01672 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms