Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01653 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01653 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01653 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01653 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01653 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01653 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
P01653 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01653 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01653 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01653 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01653 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01653 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01653 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01653 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P01653 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P01653 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P01653 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P01653 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01653 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01653 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01653 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01653 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
P01653 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
P01653 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P01653 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P01653 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
P01653 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01653 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01653 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01653 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01653 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01653 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01653 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01653 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01653 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01653 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01653 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01653 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01653 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01653 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
P01653 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01653 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01653 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
P01653 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01653 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01653 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01653 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01653 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01653 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01653 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01653 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
P01653 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01653 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01653 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01653 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01653 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01653 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01653 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01653 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01653 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01653 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01653 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01653 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01653 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01653 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01653 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01653 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01653 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01653 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01653 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01653 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
P01653 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01653 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01653 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
P01653 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
P01653 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01653 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01653 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
P01653 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01653 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
P01653 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01653 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01653 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01653 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01653 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01653 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01653 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01653 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01653 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01653 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01653 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01653 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
P01653 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01653 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01653 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01653 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01653 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01653 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
P01653 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms