Protein–RNA interactions for Protein: O89113

Ier5, Immediate early response gene 5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ier5O89113 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ier5O89113 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ier5O89113 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ier5O89113 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ier5O89113 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ier5O89113 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ier5O89113 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ier5O89113 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ier5O89113 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ier5O89113 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ier5O89113 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ier5O89113 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ier5O89113 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ier5O89113 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ier5O89113 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ier5O89113 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ier5O89113 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ier5O89113 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ier5O89113 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ier5O89113 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ier5O89113 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ier5O89113 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ier5O89113 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ier5O89113 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ier5O89113 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ier5O89113 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ier5O89113 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ier5O89113 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ier5O89113 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ier5O89113 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ier5O89113 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ier5O89113 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ier5O89113 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ier5O89113 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ier5O89113 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ier5O89113 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ier5O89113 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ier5O89113 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ier5O89113 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ier5O89113 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ier5O89113 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ier5O89113 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ier5O89113 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ier5O89113 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ier5O89113 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ier5O89113 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ier5O89113 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ier5O89113 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ier5O89113 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ier5O89113 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ier5O89113 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 524.1 ms