Protein–RNA interactions for Protein: O70439

Stx7, Syntaxin-7, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx7O70439 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx7O70439 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx7O70439 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stx7O70439 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stx7O70439 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx7O70439 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx7O70439 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx7O70439 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx7O70439 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx7O70439 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx7O70439 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx7O70439 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx7O70439 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx7O70439 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx7O70439 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx7O70439 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms