Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cdk5r2O35926 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cdk5r2O35926 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cdk5r2O35926 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cdk5r2O35926 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cdk5r2O35926 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms