Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edil3O35474 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edil3O35474 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edil3O35474 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edil3O35474 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edil3O35474 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edil3O35474 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Edil3O35474 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edil3O35474 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Edil3O35474 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Edil3O35474 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Edil3O35474 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Edil3O35474 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Edil3O35474 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Edil3O35474 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Edil3O35474 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Edil3O35474 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Edil3O35474 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Edil3O35474 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Edil3O35474 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Edil3O35474 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Edil3O35474 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Edil3O35474 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Edil3O35474 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Edil3O35474 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Edil3O35474 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Edil3O35474 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Edil3O35474 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Edil3O35474 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Edil3O35474 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Edil3O35474 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edil3O35474 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edil3O35474 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edil3O35474 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Edil3O35474 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms