Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sema6aO35464 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sema6aO35464 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sema6aO35464 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sema6aO35464 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms