Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kcns1O35173 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcns1O35173 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kcns1O35173 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kcns1O35173 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kcns1O35173 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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