Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc3aO08576 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rundc3aO08576 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc3aO08576 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rundc3aO08576 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc3aO08576 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc3aO08576 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rundc3aO08576 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc3aO08576 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc3aO08576 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc3aO08576 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc3aO08576 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rundc3aO08576 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc3aO08576 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rundc3aO08576 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rundc3aO08576 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rundc3aO08576 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc3aO08576 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rundc3aO08576 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc3aO08576 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc3aO08576 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc3aO08576 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc3aO08576 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rundc3aO08576 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc3aO08576 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc3aO08576 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc3aO08576 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc3aO08576 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc3aO08576 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc3aO08576 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rundc3aO08576 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms