Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm8050L7N2E3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm8050L7N2E3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm8050L7N2E3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8050L7N2E3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8050L7N2E3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8050L7N2E3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8050L7N2E3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8050L7N2E3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm8050L7N2E3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8050L7N2E3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8050L7N2E3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8050L7N2E3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm8050L7N2E3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8050L7N2E3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8050L7N2E3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8050L7N2E3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm8050L7N2E3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms