Protein–RNA interactions for Protein: K9J7H2

Gm4141, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4141K9J7H2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm4141K9J7H2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm4141K9J7H2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm4141K9J7H2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4141K9J7H2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms