Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20795J3QP49 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20795J3QP49 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20795J3QP49 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm20795J3QP49 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20795J3QP49 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20795J3QP49 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20795J3QP49 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20795J3QP49 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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