Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm20825J3QM67 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm20825J3QM67 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20825J3QM67 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20825J3QM67 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20825J3QM67 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20825J3QM67 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20825J3QM67 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20825J3QM67 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms