Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm21897J3KMP5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm21897J3KMP5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm21897J3KMP5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm21897J3KMP5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm21897J3KMP5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm21897J3KMP5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm21897J3KMP5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm21897J3KMP5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm21897J3KMP5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm21897J3KMP5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm21897J3KMP5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm21897J3KMP5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms