Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Arfip1G5E8V9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arfip1G5E8V9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arfip1G5E8V9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arfip1G5E8V9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfip1G5E8V9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms