Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmod3E9QA62 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmod3E9QA62 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmod3E9QA62 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmod3E9QA62 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmod3E9QA62 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms